2011.02-2014.12：深圳华大基因研究院，海洋生物平台，项目负责人；

2012.02-：深圳市海洋生物基因组学重点实验室，学术带头人；

2014.01-：广东省海洋经济动物分子育种重点实验室，副主任；

2015.01-2015.12：深圳国家基因库，海洋生物平台，技术总监；

2016.01-2024.01：深圳华大海洋科技有限公司，研发部负责人；

2016.08-2025.09：深圳市华大海洋研究院，常务副院长；

2022.09-2024.09：惠州学院兼职教授

2022.11-2025.09：大百汇现代渔业应用研究院，院长；

2023.03-2025.09：深圳市华海种业有限公司，法人代表、总经理；

2024.01-2025.09：深圳华大海洋科技有限公司，总经理；

2025.09-：广东海洋大学水产学院

广东海洋协会海洋生物分会副秘书长，深圳国际生物谷海洋生物产业专家顾问，深圳市盐田区科协常委，Nucleic Acids Research、Molecular Ecology、Communications Biology、Scientific Reports、Frontiers in Genetics、BMC Evolutionary Biology、Genomics、PLOS ONE、Aquaculture、Aquaculture and Fisheries、Animals等学术期刊的审稿人

2018年获广东省农业技术推广奖一等奖（排名第7）

2021年获深圳市自然科学奖二等奖（排名第2）

2021年获海洋科学技术奖二等奖（排名第2）

2022年获中国发明协会发明创业成果奖二等奖（排名第1）

2023年获深圳市生态科学技术奖一等奖（排名第4）

2018年获评深圳高层次人才

2022年获评深圳市示范性劳模和工匠人才创新工作室领衔人

海洋生物基因组学研究、遗传育种技术研发和深远海养殖技术研发。

1、国家重点研发计划项目“深远海养殖大规格苗种培育技术与智能装备研发”子课题，205万元，2024.12-2027.11，在研。

2、深圳市科技重大专项“多功能农业海洋微生物种质资源挖掘及新品种创制”，200万元，2024.01-2025.12，在研。

3、农业农村部物种品种资源保护项目“相关流域重要物种种质资源收集及基因保存”，100万元，2018.01-2020.12，已结题。

4、深圳市基础研究项目“鱼类基因组选择育种技术研发”，30万元，2020.05-2023.05，已结题。

5、深圳市大鹏新区科技研发项目“鳗鱼肽降血压活性机理探究及其成分鉴定”，2021.01-2022.12，40万元，已结题。

6、深圳市大鹏新区科技研发项目“弹涂鱼抗紫外相关基因功能研究”，2017.10-2019.10，25万元，已结题。

7、深圳市大鹏新区科技研发项目“石斑鱼抗氨氮及亚硝酸盐相关分子标记开发”，2017.07-2019.06，50万元，已结题。

8、深圳市大鹏新区科技研发项目“基于基因分型的石斑鱼优良种鱼鉴定技术”，2016.07-2018.06，50万元，已结题。

1、Xinxin You, et al. Construction of high-density genetic linkage maps for orange-spotted grouper Epinephelus coioides using multiplexed shotgun genotyping. BMC Genetics, 2013, 14:113.（第一作者）

2、Xinxin You, et al. Mudskipper genomes provide insights into the terrestrial adaptation of amphibious fishes. Nature Communications, 2014, 5: 5594.（第一作者）

3、Jingqun Ao, Jia Li, Xinxin You, et al. Construction of the High-Density Genetic Linkage Map and Chromosome Map of Large Yellow Croaker (Larimichthys crocea). International Journal of Molecular Sciences, 2015, 16, 26237–26248.（并列第一作者）

4、Hui Yu, Xinxin You, et al. Genome-Wide Mapping of Growth-Related Quantitative Trait Loci in Orange-Spotted Grouper (Epinephelus coioides) Using Double Digest Restriction-Site Associated DNA Sequencing (ddRADseq). International Journal of Molecular Sciences, 2016, 17 (4).（并列第一作者）

5、Xiaohui Chen, Liqiang Zhong, Chao Bian, Pao Xu, Ying Qiu, Xinxin You, et al. High-quality genome assembly of channel catfish, Ictalurus punctatus. GigaScience, 2016, 5:39.（并列第一作者）

6、Yunhai Yi, Xinxin You, et al. High-throughput indentification of antimicrobial peptides from amphibious mudskippers. Marine Drugs 2017, 15, 364.（并列第一作者）

7、Guoqing Zhang, et al., Xinxin You. Construction of high-density genetic linkage maps and QTL mapping in the golden pompano. Aquaculture, 2018, 482: 90-95.（通讯作者）

8、Hui Yu, Xinxin You, et al. A genome-wide association study on growth traits in orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) with RAD-seq genotyping. SCIENCE CHINA Life Sciences, 2018, 61(8): 934-946.（并列第一兼通讯作者）

9、Jian Liu, Xinxin You, et al. Assessing the genetic diversity of the critically endangered Chinese sturgeon Acipenser sinensis using mitochondrial markers and genome-wide single-nucleotide polymorphisms from RAD-seq. SCIENCE CHINA Life Sciences, 2018, 61(9): 1090-1098.（并列第一作者）

10、Xinxin You, et al. Mudskippers and their genetic adaptations to an amphibious lifestyle. Animals, 2018, 8, 24.（第一作者）

11、Xinxin You, et al. Transcriptomic evidence of adaptive tolerance to high environmental ammonia in mudskippers. Genomics, 2018, 110: 404-413.（第一兼通讯作者）

12、Shiyong Zhang, et al., Xinxin You. Construction of a high-density linkage map and QTL fine mapping for growth- and sex-related traits in channel catfish (Ictalurus punctatus). Frontiers in Genetics, 2019, 10: 251.（通讯作者）

13、Tengfei Xu, et al., Xinxin You. Genome resequencing of the orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) for a genome-wide association study on ammonia tolerance. Aquacuture, 2019, 512, 734332.（通讯作者）

14、Dengdong Wang,et al., Xinxin You. Whole genome sequencing of the giant grouper (Epinephelus lanceolatus) and high-throughput screening of putative antimicrobial peptide genes. Marine Drugs, 2019, 17, 503.（通讯作者）

15、Xiang Wang, et al, Xinxin You, Yong Zhang. An SNP-Based Genetic Map and QTL Mapping for Growth Traits in the Red-Spotted Grouper (Epinephelus akaara). Genes. 2019, 10(10), 793.（通讯作者）

16、Shoujia Jiang, et al, XinxinYou. Developing single nucleotide polymorphisms for identification of cod products by RAD-Seq. Animals, 2020, 10, 423.（通讯作者）

17、Xinxin You, et al. Research advances in the genomics and applications for molecular breeding of aquaculture animals. Aquaculture, 2020, 526, 735357.（第一兼通讯作者）

18、Xinxin Shan, et al, Xinxin You. Genome-wide association improves genomic selection for ammonia tolerance in the orange-spotted grouper (Epinephelus coioides). Aquaculture , 2020, 533, 736214.（通讯作者）

19、Shengtao Guo, et al, Xinxin You. Characterization of five caspase genes and their transcriptional changes in response to exogenous iridescent virus challenge in the whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei). Aquaculture, 2020, 534, 736192.（通讯作者）

20、Hongtao Liu, et al., Xinxin You. Toll protein family structure, evolution and response of the whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei) to exogenous iridescent virus. Journal of Fish Diseases, 2021, 44: 1131–1145.（通讯作者）

21、Weidong Ding, et al., Xinxin You, Min Wang, Qiong Shi, Xuwen bing. A Chromosome-Level Genome Assembly of the Mandarin Fish (Siniperca chuatsi). Frontiers in Genetics, 2021, 12:671650.（通讯作者）

22、Pengwei Xu, Chenxi Zhao, Xinxin You, et al. Draft genome of the mirrorwing flyingfish (Hirundichthys speculiger). Frontiers in Genetics, 2021, 12:695700.（并列第一作者）

23、Zijian Gao, Xinixn You, et al. A Chromosome-level genome assembly of the striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) reveals molecular mechanisms for its high-fat trait. Genomics, 2021, 113(5):3349-3356.（并列第一作者）

24、Wu Gan, et al., Xinxin You, Wei Song. Whole-Genome Sequencing and Genome-Wide Studies of Spiny Head Croaker (Collichthys lucidus) Reveals Potential Insights for Well-Developed Otoliths in the Family Sciaenidae. Frontiers in Genetics, 2021, 12:730255.（并列第一作者）

25、Xinxin Shan, et al., Xinxin You. Genomic selection of orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) based on multiplex PCR enrichment capture sequencing. Aquaculture and Fisheries, 2023, 8: 681-688.（通讯作者）