马鲅科鱼类全基因组双重突破！ ——继四指马鲅后，我院团队成功绘制 多鳞四指马鲅染色体水平精细图谱

近日，我院鱼类遗传育种与增养殖团队在马鲅科（Polynemidae）鱼类基因组研究领域取得连续突破。继此前成功组装并发布全球首个四指马鲅（Eleutheronema tetradactylum）“T2T”级基因组之后，团队再次告捷，成功构建了同属近缘物种——多鳞四指马鲅（Eleutheronema rhadinum）的染色体水平高质量基因组图谱。这一系列成果标志着我院在马鲅科鱼类种质资源数字化与基因组学研究方面走在了世界前列，相关最新研究成果已在国际知名学术期刊《Scientific Data》上发表。

多鳞四指马鲅作为马鲅科（Polynemidae）四指马鲅属的一员，广泛分布于中国（含台湾省）、日本及越南北部的沿海与近岸水域，因生长速度快、肉质优良且营养丰富，具有极高的商业与市场价值。然而，近年来受过度捕捞、海洋污染等因素影响，其野生种群面临资源衰退、保护力度不足及可持续利用受限等严峻挑战，且其基因组背景长期处于未被探索的状态。

为了揭示这一重要经济鱼类的遗传奥秘，科研团队采用了先进的全基因组测序策略，结合了PacBio SMRT（HiFi）高保真长读长测序与Hi-C染色质构象捕获技术。这种技术组合不仅确保了基因组序列的高准确性，还有效辅助了染色体水平的挂载与组装，从而构建出高连续性的参考基因组。

组装结果显示，多鳞四指马鲅的基因组全长为585.27 Mb，Contig N50达到24.22 Mb，高达99.73%的序列被精准锚定到了26条染色体上。基因组中约18.53%被识别为重复序列，并成功预测了23,090个蛋白编码基因。在基因完整性评估（BUSCO）中，该染色体水平组装的完整性得分高达99.05%，充分证明了该参考基因组的高质量与高完整度。

此次多鳞四指马鲅基因组的发布，并非孤立的成果，而是团队在马鲅科基因组学布局中的关键一环。此前，团队已率先完成了四指马鲅的T2T全基因组组装，实现了对四指马鲅基因组端粒到端粒的无间隙解读，树立了该物种的基因组“金标准”。 从四指马鲅的“极致精细（T2T）”到多鳞四指马鲅的“高质量覆盖”，团队系统性地完成了四指马鲅属两个核心经济物种的基因组解析，构建了完整的“属级”基因组数据库。这一精准的遗传图谱将有效推动该物种的进化生物学、功能基因组学研究，并为解析其种群遗传结构提供关键依据。